I am a cat.（吾輩は猫である。）
このときのamがbe動詞と言われるものですが,
ある意味もっとも基本的な文のはずなのに，中学生には難しいようです。

英文をつくるときに一般動詞（be動詞以外の動詞の事）が
あると，be動詞と一緒に使ってしまうミスがとても多いです。
例えば，He plays baseball.（彼は野球をします。）を
疑問文にしなさいと言われたら，
Is he plays baseball?
とやってしまう。
Is he a baseball player?と混同しているのかしらん。

まず，一般動詞とbe動詞の区別ははっきりさせたいですね。
疑問文（「～ですか」と聞く文）や否定文（「～でない」と否定する文）の
つくりかたもぜんぜん違いますからね。

ところで，私はbe動詞を考えるときは，
「be動詞」=「存在を表す」とイメージしています。

I am a cat.であれば，「私は猫としてこの世に存在している」ってな感じです。
であれば，よく言われる，A+be動詞+BのA=Bの関係も納得できる。
This is a pen.なら「これ=ペン」は「これ」が「ペン」としてこの世に存在しているから言えるのです。

また，レストランで注文するとき日本人がよく間違えるという，
I am coffee.（私はコーヒー）は絶対にあり得ないことがわかると思います。

まずこの辺からbe動詞について考え始めるのはどうでしょうか。